Yağlı karaciğer, perikolanjit, kronik aktif hepatit, portal ven trombozu, ilaca bağlı pankreatit ve siroz inflamatuvar bağırsak hastalığının hepatik komplikasyonlarındandır. Safra yolları komplikasyonları arasında ise sklerozan kolanjit ve safra taşı sayılabilir. %50-80 gibi yüksek bir yaygınlık oranı ile perikolanjit İBH’da en sık gözlenen hepatik komplikasyondur. Çoğunlukla asemptomatiktir ve sıklıkla ALP düzeyinde artış ile daha az oranda bilirubin yüksekliği ile seyreder.