Apolipoprotein A-II, insanlarda APOA2 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Yüksek yoğunluklu lipoprotein parçacıklarının en bol bulunan ikinci proteinidir. Protein, plazmada apolipoprotein D ile monomer, homodimer veya heterodimer olarak bulunur. ApoA-II, HDL metabolizmasındaki birçok adımı düzenler ve koroner kalp hastalığındaki rolü belirsizdir. Dikkat çekici bir şekilde, bu gendeki kusurlar apolipoprotein A-II eksikliğine veya hiperkolesterolemiye neden olabilir