APOA5 esas olarak plazma trigliserit seviyelerini etkilemek için işlev görür . Önerilen ilk mekanizma, APOA5’in lipoprotein lipazın (trigliserit katabolizmasında önemli bir enzim olan) bir aktivatörü olarak işlev gördüğünü ve bu süreç yoluyla TG açısından zengin parçacıkların metabolizmasını artırdığını varsayar. İkincisi, APOA5’in VLDL parçacıklarının salgılanması üzerindeki olası etkisidir , çünkü APOA5 hücre zarlarına ve lipitlere bağlanarak VLDL parçacık üretimini ve montajını inhibe ederek hepatik üretimi azaltır.
Son olarak, üçüncü olasılık lipoprotein kalıntılarının hepatik alımının hızlanmasıyla ilgilidir ve APOA5’in düşük yoğunluklu lipoprotein reseptör ailesinin farklı üyelerine bağlandığı gösterilmiştir . TG düşürücü etkisine ek olarak, APOA5 ayrıca HDL olgunlaşmasını ve kolesterol metabolizmasını düzenlemede önemli bir rol oynar .
Artan APOA5 düzeyleri , VLDL’den büyük HDL parçacıklarına doğru çarpık kolesterol dağılımıyla ilişkilendirilmiştir . APOA5 mRNA’sı karaciğer rejenerasyonu sırasında yukarı düzenlenir ve bu, APOA5’in hepatosit proliferasyonunda bir işlevi olduğunu düşündürmektedir. Ayrıca APOA5’in beta hücrelerinde insülin salgılanmasını artırabileceği ve hücre yüzeyinin orta kısmının APOA5 endositozunda rol oynayabileceği bildirilmiştir