Tıbbi Biyokimya

TRPV “Transient Receptor Potential Vanilloid” reseptörleri.

yazar

Grup Kanal İşlev Doku Dağılımı Ca 2+ /Na +Seçiciliği Heteromerik İlişkili Alt Birimler Diğer İlişkili Proteinler I TRPV1 vanilloid (kapsaisin) reseptörü ve zararlı termal sensör (43 °C) TRPV proteinleri sarımsak ( allisin ) tadına tepki verir .  TRPV1, ısı ve iltihaplanma duyumlarına katkıda bulunur ve kapsaisin ve piperin ile ilişkili acılık ve ağrı duyumuna aracılık eder . Merkezi sinir sistemi ve periferik sinir sistemi 9:1 TRPV2, TRPV3 Kalmodulin , PI3 kinaz TRPV2 ozmotik ve … Devamını oku

Glutamat dehidrojenaz, hem NAD hem de NADP’ yi koenzim olarak kullanabilen bir enzimdir. Reaksiyon mitokondride gerçekleşir ve reversibl olup yönü glutamat, a-ketoglutarat ve amonyak konsantrasyonuna ve okside: redükte koenzimlerin oranına bağlıdır. örnek; protein içeren bir yemeğin yenmesinden sonra karaciğerdeki glutamat düzeyleri yükselir. Reaksiyon amino asit yıkımı ve amonyak oluşumu yönünde ilerler. ATP ve GTP, giutamat dehidrojenazın allosterik inhibitörleri; GDP ve ADP ise aktivatörüdürler. Bu şekilde hücre içinde enerji düzeyi düşük olduğunda glutamat dehidrojenaz tarafından glutamat yıkımı artar ve elde edilen a-ketoglutarat TCA döngüsü için substrat olarak kullanılır. Katalizlediği reaksiyonda açığa çıkan serbest amonyak üre döngüsünün ilk basamağında karbamoil fosfat sentetaz-1 için substrattır.

yazar

Üre döngüsünün ilk ve düzenleyici basamağı karbamoil fosfat sentetaz-1 ‘in katalizi ile gerçekleşir. Karbamoil fosfat sentetaz-1 enzimi; 2 mol ATP, karbondioksit ve amonyağa ihtiyaç duyar. Reaksiyonda yüksek enerjili bir fosfat bileşiği olan karbamoil fosfat oluşur

yazar

Karbamoil Fosfat Sentetaz-1 (CPS-1), bu sürecin sadece bir başlangıcı değil, aynı zamanda en sıkı denetlenen kontrol noktasıdır. Reaksiyonun Kimyası ve Maliyeti CPS-1 enzimi, mitokondri matrisinde gerçekleşen bu ilk adımda basit inorganik maddeleri karmaşık ve yüksek enerjili bir moleküle dönüştürür: CPS-1: “Aç-Kapa” Mekanizması (N-Asetilglutamat) CPS-1 enzimi vücutta her an aktif değildir. Aktifleşmesi için N-asetilglutamat (NAG) adı … Devamını oku

Üre döngüsünün düzenleyici enzimi “sentetaz” enzimidir. Sentetaz enzimleri Iigaz enzim grubuna giren ve reaksiyonlarında mutlaka enerji maliyeti gerektiren enzimlerdir.

yazar

Üre Döngüsünün Düzenleyici Enzimi: Karbamoil Fosfat Sentetaz I (CPS-I) Üre döngüsünün hız kısıtlayıcı ve ilk basamağı olan bu enzim, mitokondride bulunur. “Sentetaz” ve “Sentaz” Ayrımı Biyokimya sınavlarında ve literatürde bu ayrım oldukça kritiktir: Özellik Sentetaz (Synthetase) Sentaz (Synthase) Enzim Sınıfı Ligaz (Sınıf 6) Genellikle Liyaz (Sınıf 4) veya Transferaz Enerji (ATP/GTP) Mutlaka enerji harcar. Enerji … Devamını oku

Üre döngüsünde açığa çıkan fumaratın karbon iskeletini sağlayan amino asit Aspartat’tır.

yazar

Bu süreç, üre döngüsü ile sitrik asit döngüsünün (TCA) birbirine bağlandığı “Krebs Bisikleti” (Bicyle) olarak bilinen noktada gerçekleşir. Aspartat, üre döngüsüne direkt olaral katılır. Azotlarından biri ürenin yapısına katılırken, karbon iskeleti arininosüksinat liyaz basamağında, fumarat olarak açığa çıkar. Mekanizma Nasıl İşler? Fumaratın Akıbeti ve Aspartat Bağlantısı Açığa çıkan fumarat doğrudan sitrik asit döngüsüne (TCA) girebilir … Devamını oku

Ökaryotlarda DNA replikasyon basamakları

yazar

Ökaryotlarda DNA replikasyonu, prokaryotlara göre çok daha karmaşık ve sıkı denetlenen bir süreçtir. Paylaştığınız bu basamaklar, genetik bilginin hatasız bir şekilde kopyalanması için izlenen hiyerarşiyi çok iyi özetliyor. Bu süreci moleküler detaylarıyla şu şekilde derinleştirebiliriz: 1. Replikasyon Orjininin Belirlenmesi ve Başlangıç Ökaryotik kromozomlar çok büyük olduğu için tek bir noktadan kopyalanamazlar. 2. DNA’nın Çözülmesi (Helikaz … Devamını oku

Birer kemoterapötik ajan olarak kullanılan Desitabin ve 5-azadeoksisitidin DNA metietoposit ve teniposit insanda bulunan tip II transferaz enzimini inhibe eder. Topoizomeraz inhibitörüdür

yazar

Desitabin ve 5-Azasitidin (DNA Metiltransferaz İnhibitörleri) Bu ilaçlar, sizin de belirttiğiniz gibi DNA metiltransferaz (DNMT) enzimini hedef alırlar. Etopozid ve Tenipozid (Tip II Topoizomeraz İnhibitörleri) Bu ilaçlar, antrasiklinlerden farklı olarak interkalasyon yapmadan doğrudan Tip II Topoizomeraz enzimini hedef alırlar. Özet Karşılaştırma Tablosu İlaç Grubu Hedef Enzim Temel Etki Desitabin / 5-Azasitidin DNA Metiltransferaz DNA Hipometilasyonu … Devamını oku

Antrasiklinler olarak da bilinen dokzorubisin, daunorubisin, idarubisin, eplrubisin ve eliptisin gibi anti tumör antibiyotikler, tip II topoizomeraz enzimini inhibe edebilir.

yazar

Antrasiklin grubu ilaçlar, bakteriyel kökenli (Streptomyces türlerinden elde edilen) “antitümör antibiyotikler” olarak sınıflandırılırlar. Antrasiklinlerin (Dokzorubisin, Daunorubisin vb.) kanser hücrelerini öldürmek için kullandığı çok yönlü mekanizmaları şu şekilde detaylandırabiliriz: Tip II Topoizomeraz İnhibisyonu Antrasiklinlerin en temel etkisi, sizin de belirttiğiniz gibi Tip II Topoizomeraz üzerinedir. İnterkalasyon (Araya Girme) Antrasiklinler, düzlemsel bir halka yapısına sahiptir. Serbest Radikal … Devamını oku