Yersinia pestis evrim, vektör etkileşimi ve patogenez

YERSINIA PESTIS (VEBA): EVRİM, VEKTÖR ETKİLEŞİMİ VE PATOGENEZ

Genetik kanıtlar Y. pestis‘in yakın evrimsel geçmişte (7.000–50.000 yıl önce) enterik (bağırsak) patojeni Y. pseudotuberculosis‘ten türemiş bir klon olduğunu göstermektedir. Fekal-oral yolla bulaşan bir enfeksiyondan, artropodlar (eklembacaklılar) ve geniş bir memeli konakçı yelpazesinin dönüşümlü olarak parazite edildiği iki aşamalı bir yaşam döngüsüne geçiş; iki plazmit geninin kazanılması (pPCP1/pPst üzerinde pla ve pFra/pMT1 üzerinde ymt) ve Y. pseudotuberculosis‘e ait bir avuç genin inaktive edilmesiyle gerçekleşmiştir. Bu süreç, Y. pseudotuberculosis atasının halihazırda sahip olduğu virülans plazmidi pYV ve septisemi yapabilme yeteneği gibi öncül özelliklerle birleşmiştir.

Yaşam döngüsünün artropodları parazite eden kısmında Y. pestis, bakteri içeren bir kan öğününün alınmasından sonra pirenin orta bağırsağında çoğalır ve biyofilm içine gömülü agregatlar (kümeler) oluşturur. Bazı pirelerde biyofilme gömülü bakteriler zamanla proventrikulusu (özofagusu orta bağırsağa bağlayan bir kapakçık) doldurur ve normal kan emmeyi engeller (tıkar). Hem “tıkanmış” pireler hem de tam bir tıkanma olmaksızın biyofilme gömülü Y. pestis kitleleri içeren pireler, her ısırma bölgesine Y. pestis inoküle eder (bulaştırır). Y. pestis‘in çoğu konakçıdan alınan enfekte kanla beslenen pirelerde kolonize olma ve çoğalma yeteneği, pFra (pMT1) plazmidindeki ymt geni tarafından kodlanan fosfolipaz D‘yi gerektirir; biyofilm sentezi ise Y. pseudotuberculosis ile paylaşılan kromozomal hms lokusunu gerektirir. Yakın zamanda, Y. pestis‘in kahverengi sıçandan (Rattus norvegicus) beslenen pireleri enfekte etmek ve bunlardan taşınmak için bozulmamış bir ymt genine ihtiyaç duymadığı, ancak siyah sıçandan (Rattus rattus) alınan kan için bunun gerekli olduğu gösterilmiştir. Y. pseudotuberculosis‘in biyofilm oluşumunu engelleyen veya yıkımını artıran üç geni, üreaz geni ile birlikte Y. pestis‘te inaktive edilmiştir (aksi takdirde üreaz aktivitesi pirede akut gastrointestinal toksisiteye neden olur). Tıkanma, pirenin ilk enfeksiyonundan sonra günler veya haftalar alır ve bunu pirenin ölümü takip eder. Birçok pire vektörü (X. cheopis dahil), beslenmeden sonraki bir haftaya kadar tıkanmamış erken evrede de vebayı bulaştırabilir, ancak bir memeli konakçıyı enfekte etmek için bu durumdaki 10 pire gereklidir (kitlesel bulaş).

Y. pestis‘in memeli konakçıda inokülasyon bölgesinden yayılması, başlangıçta küçük pPCP1 (pPst) plazmidi tarafından kodlanan plazminojen aktivatörü Pla‘ya bağlıdır. Bu yüzey protezi, memeli plazminojenini aktive eder, komplemanı degrade eder (yıkıma uğratır) ve ekstraselüler matris bileşeni olan laminine tutunur. Pla, farelerde subkutan veya intradermal enjeksiyonla (pire ısırığının laboratuvar modelleri) yüksek düzeyde virülans için ve primer pnömonik vebanın gelişimi için esastır. Fare modellerinde gerçek pire ısırığı inokülasyonu kullanıldığında, pFra üzerinde kodlanan fimbriyal kapsül oluşturan protein (Ca1 veya fraksiyon 1; F1 antijeni) bulaşma verimliliğini artırır ve bubo (veba hıyarcığı) oluşumu için plazminojen aktivatörü gereklidir.

Paleogenomik (eski insan kalıntılarının dişlerinden elde edilen DNA ekstraktlarının dizilenmesi), 14. yüzyıldaki Kara Ölüm ve 6. yüzyıldaki Jüstinyen Vebası’na Y. pestis‘in neden olduğunu göstermekte ve Kara Ölüm mortalitesinin, günümüzde otoimmün hastalıklarla ilişkili olan koruyucu immün yanıt gen varyantlarını seçtiğini (evrimsel olarak ayı ayıkladığını) düşündürmektedir. Ayrıca Y. pestis enfeksiyonunun Tunç Çağı ve Neolitik dönemde Avrasya’da yaygın bir ölüm nedeni olduğunu ortaya koymuştur. Dikkat çekici bir şekilde, 4000 yıldan daha eski bazı kalıntılardan elde edilen Y. pestis dizilerinde pFra (pMT1) plazmidinde ymt geni bulunmazken, pla geni bozulmamış üreaz ve biyofilm düzenleyici genlerle birlikte mevcuttur. Bu durum, vebanın pire kaynaklı bulaşma tam olarak optimize edilmeden önce, muhtemelen pnömonik (akciğer) veya gastrointestinal yol yoluyla yayılan, yaygın ve ölümcül bir insan enfeksiyonu olduğunu düşündürmektedir.

Makrofajlar, nötrofiller ve dendritik hücrelerin tümü, pire ile bulaşan Y. pestis‘e karşı doğuştan gelen immün yanıtta rol oynar. Mikroorganizma makrofajlar tarafından alınır ancak otofaji yoluyla öldürülmekten kaçınır; ayrıca nötrofillerde de hayatta kalabilir ve çoğalabilir. Bakterilerin bölgesel lenf düğümlerine hızlı transportu gerçekleşir. Y. pestis daha sonra anti-fagositik sistemlerinin tam ekspresyonu ile hücre dışı (ekstraselüler) replikasyona uğrar: pYV tarafından kodlanan tip III sekresyon makineleri ve efektörlerinin yanı sıra F1 kapsülü devreye girer. Bu faktörler nötrofillerin bakteriyi almasını engeller; tip III sekresyon efektörleri ayrıca nötrofiller tarafından mikrobisidal DNA fırlatılmasını (NET oluşumunu) bloke eder ve apoptotik hücre ölümünü tetikler. İmmün hücre hedeflemesi, fagositik hücreler üzerindeki N-formilpeptit reseptörünün (FPR1), tip III sekresyon sisteminin iğne ucu kapak proteini olan LcrV tarafından bağlanmasını takip eder. LcrV’nin aşırı üretimi anti-inflamatuar bir etki de göstererek konakçı immün yanıtlarını azaltır. Benzer şekilde, Y. pestis lipopolisakkariti (LPS), konakçının Toll-benzeri reseptör 4’ünün (TLR-4) uyarılmasını en aza indirecek şekilde modifiye edilmiştir; böylece periferik enfeksiyon sırasında koruyucu konakçı inflamatuar yanıtları azaltılır ve konakçının yüksek dereceli bakteriyemi ile hayatta kalma süresi uzatılır—bu etki muhtemelen patojenin daha sonra pire ısırığıyla bulaşmasını artırır.

Y. pestis‘in bölgesel bir lenf düğümünde replikasyonu, lenf düğümünün ve periglandüler (bez çevresi) bölgenin yerel olarak şişmesiyle sonuçlanır ve bu durum bubo olarak bilinir. Histolojide, lenf düğümünün hemorajik veya nekrotik olduğu, kan damarlarının tromboze olduğu, lenfoid hücrelerin ve normal mimarinin yerini çok sayıda bakteri ve fibrinin aldığı görülür. Periglandüler dokular inflamasyonludur ve ayrıca serosanguinöz (kanlı-savsu), jelatinöz bir eksüda içinde çok sayıda bakteri içerir.

Lenfatik damarlar yoluyla bitişik lenf düğümlerine sürekli yayılım, ikinci derece primer buboları üretir. Enfeksiyon, geçici bakteriyemi tespit edilebilmesine rağmen, başlangıçta enfekte bölgesel lenf düğümlerinde sınırlandırılır. Enfeksiyon ilerledikçe, efferent lenfatikler yoluyla duktus torasikusa yayılım yüksek dereceli bakteriyemi üretir. Bunu dalak, karaciğer ve sekonder bubolara hematojen yayılım izler ve ardından ölüme yol açan kontrolsüz septisemi gelişir. Bazı hastalarda bu septisemik evre, belirgin bir bubo gelişimi veya akciğer hastalığı olmaksızın gerçekleşir (septisemik veba). Akciğerlere hematojen yayılım, bakterilerin başlangıçta hava boşluklarından ziyade interstisyumda daha belirgin olduğu sekonder veba pnömonisine yol açar (primer veba pnömonisinde durum bunun tersidir). Menenjit dahil olmak üzere diğer organlara hematojen yayılım meydana gelebilir.


Klinik ve Moleküler Analiz

  1. Evrimsel Dönüşüm Mekanizması:Y. pestis, bir bağırsak patojeni olan Y. pseudotuberculosis‘ten yatay gen transferiyle plazmit kazanarak evrilmiştir. Normalde memelilerde ağır ishale yol açan atasal tür, iki temel plazmit kazanmıştır:
    • pPCP1 (Pla): Dokuları eriten plazminojen aktivatörünü kodlar. Bakterinin pire ısırık yerinden lenf noduna sızmasını ve orada nekrotik harabiyet yapmasını sağlar.
    • pFra (ymt ve F1): ymt geni (fosfolipaz D), bakterinin pirenin midesindeki toksik kan bileşenlerinden korunmasını sağlar. F1 antijeni ise memelide antifagositik kapsül oluşturur.
  2. Pire İçindeki “Tıkanma” (Blockage) Fenomeni: Bakteri kromozomal hms lokusu sayesinde pirenin ön midesinde (proventrikulus) devasa bir biyofilm örer. Pirenin midesi tıkanınca aç kalır, sürekli memelileri ısırır ve her ısırmada tıkanan kapakçık yüzünden kanı geri kusarak bakterileri yaraya pompalar. Y. pestis, atasındaki üreaz genini kapatmıştır; çünkü üreaz pirenin bağırsaklarını delip pireyi erken öldürmekteydi.
  3. İmmün Sistemden “Görünmezlik” Stratejisi: Bakteri tam bir “kamuflaj” ustasıdır. Periferik kanda gezerken LPS yapısını değiştirir. Normal Gram-negatif bakterilerin LPS’si TLR-4’ü aşırı uyararak septik şok yaparken, veba LPS’si sessiz kalır. Böylece vücut başlangıçta vebaya karşı inflamasyon (ateş/hücre göçü) başlatamaz, bakteri kanda trilyonlarca sayıya ulaşana kadar konakçı sinsi bir şekilde yaşar.
  4. Primer vs. Sekonder Pnömonik Veba Ayırımı:
    • Primer Pnömonik Veba: Doğrudan hasta bir insanın öksürüğüyle havadan (aerosol) bulaşır. Bakteri alveollere (hava boşluklarına) yerleşir. Pla proteini burada esastır.
    • Sekonder Pnömonik Veba: Pire ısırığıyla başlar, bubo oluşur, kanda çoğalan bakteri (septisemi) akciğere yerleşir. Histopatolojik olarak bakteri ilk önce interstisyumda (akciğer dokusunda) birikir, hava boşluklarında değil.

Soru 1: Moleküler Genetik ve Vektör Patogenezi

Yersinia pestis’in atasal suşu olan Yersinia pseudotuberculosis’ten evrilerek pire-memeli döngüsüne sahip ölümcül bir patojene dönüşme süreci ve vektör içindeki yaşam döngüsü ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi yanlıştır?

A) Fekal-oral bulaştan iki aşamalı yaşam döngüsüne geçişte pPCP1 plazmidindeki pla ve pFra plazmidindeki ymt genlerinin kazanılması kritik rol oynamıştır.
B) Pire orta bağırsağında ve proventrikulusunda tıkanmaya (blockage) yol açan biyofilm agregatlarının sentezi, atasal suşla ortak olan kromozomal hms lokusu tarafından yönetilir.
C) Y. pestis, pirede akut gastrointestinal toksisiteye neden olarak vektörün erken ölümünü engellemek amacıyla atasında aktif olan üreaz genini evrimsel süreçte inaktive etmiştir.
D) PFra plazmidindeki ymt geni tarafından kodlanan fosfolipaz D enzimi, bakterinin siyah sıçan (Rattus rattus) kanı emmiş pirelerde kolonize olması için mutlak gerekliyken, kahverengi sıçan (Rattus norvegicus) kanında bu zorunluluk yoktur.
E) Pirenin proventrikulusunda tam tıkanma oluşmayan “erken evre (unblocked)” pirelerin vebayı kitlesel (kitle transmisyonu) olarak bulaştırabilmesi için tek bir farenin sadece bir pire tarafından ısırılması yeterlidir.

  • Doğru Cevap: E
  • Açıklama: Tıkanmamış (unblocked) erken evredeki pirelerin vebayı memeli bir konakçıya bulaştırabilmesi için en az 10 pirenin toplu olarak beslenmesi (mass transmission) gereklidir. Tek bir pire enfeksiyon için yetersiz kalır. Diğer şıklar moleküler patogenez verileriyle tamamen doğrudur.

Soru 2: Moleküler İmmünoloji ve Hücresel Kaçış

Yersinia pestis enfeksiyonları sırasında konakçının doğuştan gelen (innate) immün sisteminden kaçış mekanizmaları düşünüldüğünde, aşağıdakilerden hangisi patojenin kullandığı stratejilerden biri değildir?

A) Makrofajlar tarafından fagosite edildikten sonra sitoplazmik otofaji mekanizmalarıyla öldürülmekten kaçınabilmesi
B) Tip III sekresyon sisteminin iğne ucu kapak proteini olan LcrV aracılığıyla fagositer hücrelerdeki N-formilpeptit reseptörüne (FPR1) bağlanarak hücreleri hedeflemesi
C) Aşırı LcrV üretimi gerçekleştirerek konakçıda pro-inflamatuar sitokin fırtınasını erken evrede tetiklemesi ve akciğer hasarı yapması
D) Tip III sekresyon efektörleri aracılığıyla nötrofillerin mikrobisidal DNA fırlatmasını (NET oluşumunu) bloke etmesi ve nötrofillerde apoptozu indüklemesi
E) Lipopolisakkarit (LPS) yapısını modifiye ederek Toll-benzeri reseptör 4 (TLR-4) uyarımını en aza indirmesi ve periferik inflamasyonu baskılaması

  • Doğru Cevap: C
  • Açıklama: LcrV proteininin aşırı üretimi pro-inflamatuar değil, tam tersine anti-inflamatuar bir etki gösterir. Bu sayede konakçının immün yanıtını baskılar, iltihabı azaltır ve bakterinin kanda sessizce çoğalmasına izin verir.

Soru 3: Histopatoloji ve Klinik Formların Ayırımı

Veba enfeksiyonunun memeli konakçıdaki sistemik yayılımı, histopatolojik özellikleri ve klinik varyantları ile ilgili aşağıdaki ifadelerden hangisi doğrudur?

A) Bölgesel lenf düğümünde oluşan ve “bubo” olarak adlandırılan yapılarda histolojik olarak normal lenfoid mimari korunmuş olup yoğun nötrofil infiltrasyonu baskındır.
B) İnokülasyon bölgesinden lenf nodlarına yayılım ve primer pnömonik veba gelişimi, pFra plazmidinde kodlanan kapsüler F1 antijenine mutlak bağımlıdır.
C) Septisemik veba tablosunun gelişebilmesi için klinik süreçte mutlaka öncesinde belirgin bir bubo (hıyarcık) veya primer akciğer hastalığının oluşması şarttır.
D) Pire ısırığı sonrası gelişen septisemiye bağlı sekonder veba pnömonisinde bakteriler histopatolojik olarak ilk önce akciğer interstisyumunda belirginleşirken, inhalasyonla gelişen primer veba pnömonisinde tam tersi bir yerleşim (hava boşlukları/alveol önceliği) izlenir.
E) Periglandüler dokulardaki jelatinöz eksüda içerisinde fibrin birikimi izlenirken bakteri odağına rastlanmaz.

  • Doğru Cevap: D
  • Açıklama: Hematojen yayılımla oluşan sekonder veba pnömonisinde bakteriler başlangıçta hava boşluklarından ziyade interstisyumda birikir. İnhalasyonla doğrudan bulaşan primer veba pnömonisinde ise durumun tam tersi geçerlidir (yani hava boşluklarında/alveollerde birikir). A yanlıştır (normal mimari tamamen yıkılır, nekroz ve hemoraji olur), B yanlıştır (lenf noduna yayılım ve primer pnömoni için Pla esastır), C yanlıştır (septisemik veba bubo olmadan da gelişebilir).