Pernisiyöz anemi, B12 vitamininin kas içi enjeksiyonlarıyla kolayca tedavi edilebilir . Başlangıçta yüksek günlük dozlarda, daha sonra durum iyileştikçe daha seyrek düşük dozlarda uygulanır. Erken tedavi edilmezse, nörolojik sorunların bazıları veya tamamı kalıcı hale gelebilir. Aneminin daha ciddi vakalarında, hematolojik etkileri gidermek için kan transfüzyonu gerekebilir.Tedavi ömür boyudur.
Hapların semptomları iyileştirme veya ortadan kaldırmada kas içi enjeksiyonlar kadar etkili olup olmadığı konusunda yeterli çalışma yoktur. B12 vitamini yerine konmazsa folat takviyesi pernisiyöz aneminin seyrini ve tedavisini etkileyebilir .