IgA nefropatisi patogenezinde tanımlanmış mekanizmalar; Hastalığın gelişiminde, mukozal B lenfositlerince üretilmiş yeterince galaktozilize edilememiş polimerik IgA1’in glomerüllerde depolanması suçlanmaktadır.

1-Patojenik IgA1 üretiminde artış

a- Mukazal infeksiyonlar ve alerjik uyarılara cevap olarak artmış polimerik IgA1 lambda üretimi

b-IgA1 O-galaktozilizasyonunda yetersizlik

c- IgA1 sializasyonunda değişiklik

2-Azalmış IgA1 klirensi

a- Azalmış sistemik klirens

b-Azalmış mezangial klirens

3-Glomerüler hasar oluşumu

a-IgA depolanmasına bağlı mezangial hücre aktivitesinde artış

b-Mezangial hücrelerden salınan mediatörlerin podosit hasarına yol açması

c-Lokal kompleman aktivasyonu