FLAP , 5-lipoksijenazın aktivasyonu ve dolayısıyla lökotrienlerin , 5-hidroksieikosatetraenoik asidin , 5-okso-eikosatetraenoik asidin ve lipoksin ve resolvin sınıflarının özel pro-çözünme aracı maddelerinin üretimi için gereklidir. Nükleer zar içinde integral bir proteindir. FLAP, solunum ve kardiyovasküler hastalıklarda rol oynayan inflamasyonun lipid aracı maddeleri olan lökotrien sentezinde gereklidir. FLAP, 5-lipooksijenaz için bir membran çapası ve bir amino asit bağlayıcı protein olarak işlev görür. FLAP’ın 5-lipooksijenazı nasıl aktive ettiği tam olarak anlaşılamamıştır, ancak ikisi arasında fiziksel bir etkileşim vardır.
FLAP yapısı 4 transmembran alfa helisinden oluşur, ancak bunlar bir fıçı oluşturan trimer halinde bulunur
Sentezlenmesi için FLAP proteinine ihtiyaç duyan lökotrienlerin , alerjik ve solunum yolu hastalıklarında bilinen bir patolojik rolü vardır. Hayvan ve insan genetik kanıtları, bunların ateroskleroz , miyokard enfarktüsü ve inmede de önemli bir rol oynayabileceğini düşündürmektedir. FLAP’ın yapısı, solunum ve kardiyovasküler hastalıklar için yeni tedavilerin geliştirilmesi ve FLAP’ın hücre biyolojisini ve lökotrien biyosentezindeki rolünü araştırmak için odaklanmış deneylerin tasarlanması için bir araç sağlar.