| SLE (Sistemik Lupus Eritematozus) | ANA pozitifliği en tipik durumdur (> %95). Anti-dsDNA, anti-Sm gibi spesifik antikorlarla birlikte bulunur. |
| Skleroderma (Sistemik skleroz) | ANA genellikle pozitiftir; anti-Scl-70 (topoizomeraz I) veya anti-sentromer antikorları ile birlikte. |
| İlaç ilişkili lupus | Hidralazin, prokainamid, izoniazid gibi ilaçlar sonrası gelişir. ANA (+), anti-histon antikoru tipiktir. |
| Enfeksiyöz mononükleoz | EBV enfeksiyonunda geçici ANA pozitifliği olabilir (spesifik değildir). |
| Juvenil artrit (özellikle sistemik tip) | ANA pozitifliği hastalığın alt tipine göre değişir; göz tutulumu (üveit) riskiyle ilişkilidir. |
| Kronik aktif hepatit (özellikle otoimmün hepatit tip 1) | ANA ve anti-smooth muscle antikorları (ASMA) pozitiftir. |
| Juvenil dermatomyozit / Polimyozit | ANA sıklıkla pozitiftir; anti-Mi-2, anti-Jo-1 gibi spesifik antikorlar eşlik edebilir. |
| Hiperreaktivite / Hipereksitabilite sendromları | Spesifik olmayan düşük titre ANA pozitifliği olabilir. |
| Vaskülitik hastalıklar | PAN, MPA, SLE’ye bağlı vaskülitlerde ANA pozitifliği görülebilir. |