| Benign lezyonlar | Verruka vulgaris (deri siğili) | HPV 2, 4 | En sık görülen deri siğili |
| Plantar verruka | HPV 1, 4 | Ayakta plantar siğil |
| Verruka plana (düz siğil) | HPV 3, 10 | Çocuklarda yüz/ellerde düz siğiller |
| Juvenil larengeal papillom | HPV 6, 11 | Solunum yolunda rekürren papillomatozis |
| Kondiloma akuminatum (genital siğil) | HPV 6, 11 (benign) | “Karnabahar görünümlü” lezyon |
| Premalign lezyonlar | Servikal intraepitelyal neoplazi (CIN I–III) | HPV 16, 18, 31, 33 | Yüksek riskli tipler |
| Vulvar intraepitelyal neoplazi (VIN) | HPV 16, 18 | Yüksek riskli tipler |
| Anal intraepitelyal neoplazi (AIN) | HPV 16, 18 | HIV pozitiflerde daha sık |
| Oral/orofaringeal intraepitelyal neoplazi | HPV 16 | Özellikle orofaringeal karsinom öncüsü |
| Malign tümörler | Serviks karsinomu (özellikle skuamöz) | HPV 16, 18 (ayrıca 31, 33, 45) | En güçlü ilişkili kanser |
| Anogenital skuamöz hücreli karsinomlar (vulva, vajen, penis, anus) | HPV 16, 18 | |
| Orofaringeal skuamöz hücreli karsinom | HPV 16 | Dil kökü, tonsil karsinomu ile ilişkili |
| Nadiren deri skuamöz hücreli karsinom | HPV 5, 8 | Özellikle immünsüprese kişilerde |