Proteinlerde Kodlanan Aminoasitler (22 Aminoasit)

GrupAminoasitlerÖzellik / Not
Nonpolar (hidrofobik)Glisin (Gly), Alanin (Ala), Valin (Val), Lösin (Leu), İzolösin (Ile), Metiyonin (Met), Prolin (Pro), Fenilalanin (Phe), Triptofan (Trp)Hidrofobik çekirdek, protein katlanması
Polar, yüklü olmayanSerin (Ser), Treonin (Thr), Asparajin (Asn), Glutamin (Gln), Tirozin (Tyr), Sistein (Cys)H-bağı, kovalent bağlar (ör. disülfit köprüsü – Cys)
Asidik (negatif yüklü)Aspartik asit (Asp), Glutamik asit (Glu)Karboksil grubu taşır
Bazik (pozitif yüklü)Lizin (Lys), Arjinin (Arg), Histidin (His)Pozitif yük, DNA/protein etkileşimleri
Standart dışı (özel)Selenosistein (Sec, U)– Kodon: UGA (stop normalde)
– SECIS element + tRNA^Sec ile translasyona eklenir
– Selenyum içerir
– Yer: Antioksidan enzimler (glutatyon peroksidaz, tiyoredoksin redüktaz, iyodotironin dejodinaz)
Pirolizin (Pyl, O)– Kodon: UAG (stop normalde)
– tRNA^Pyl aracılığıyla translasyona eklenir
– Metanojenik arkea ve bazı bakterilerde bulunur
– Yer: Metan metabolizmasında metiltransferaz enzimleri

Klinik Püf Noktaları

  • Metiyonin: Evrensel başlangıç kodonu (AUG).
  • Selenosistein: İnsan proteinlerinde bulunur → “21. aminoasit”.
  • Pirolizin: Arkea/bakterilerde → “22. aminoasit”.
  • Histidin: Fizyolojik pH’a en yakın pKa → enzim aktif merkezlerinde kritik.
  • Triptofan & Fenilalanin: Aromatik → prekürsör hormon/nt (serotonin, dopamin).

Özet: Protein sentezinde 20 standart aminoasit + 2 özel (Selenosistein, Pirolizin) olmak üzere toplam 22 aminoasit kodlanabilir.