Lipoprotein lipaz, kapiller endotel hücre dış yüzeyinde heparan sülfatın proteoglikan birimlerine bağlı bulunur. Glikozaminoglikanlardan Heparin, kapiller endotel hücresinin yüzeyinde bulunan “Lipoprotein lipaz” ı heparan sülfat kancaların’ dan ayrılarak plazmaya salınımını ve plazmadaki etkisini arttırır.

LPL, kılcal damarların çeperlerindeki endotel hücrelerde bulunur. Enzim, hücrelerin yüzeyinde, damar lümeni tarafında bulunan, eksi yüklü heparan sulfat-proteoglikan (HSPG) moleküllerine bağlıdır. Enzim reaksiyonu sonucu oluşan yağ asitleri hücreye girdikten sonra ya yakılırlar ya da depo cisminde tekrar triglserite dönüştürülürler.