Apolipoprotein AI (apoA1) , daha az miktarda diğer lipoproteinlerde bulunmasına rağmen, yüksek yoğunluklu lipoproteinlerin (HDL) başlıca yapısal protein bileşenidir . Apolipoprotein A-IV (apoA4), kilomikronlarda , çok düşük yoğunluklu lipoproteinlerde (VLDL) ve HDL’de bulunur . Başlıca ters kolesterol taşınmasında ve kilomikron montajı ve salgılanması yoluyla bağırsak lipid emiliminde etki ettiği düşünülmektedir. Hipotalamusta sentezlenen ApoA-IV’ün, kemirgenin yiyecek alımını düzenleyen tokluk faktörü olduğu ileri sürülmektedir.