Mikrokok genellikle saprotrofik veya ortak bir organizma olarak düşünülür, ancak özellikle HIV hastaları gibi bağışıklık sistemi zayıf olan konaklarda fırsatçı bir patojen olabilir. Organizma normalde cilt mikroflorasında bulunduğundan ve cins nadiren hastalıkla bağlantılı olduğundan, Micrococcus’u bir enfeksiyonun nedeni olarak tanımlamak zor olabilir. Nadir durumlarda, Micrococcus’un neden olduğu pulmoner enfeksiyonlardan bağışıklık sistemi baskılanmış hastaların ölümü meydana gelmiştir. Mikrokoklar, tekrarlayan bakteriyemi, septik şok, septik artrit, endokardit, menenjit ve kavitasyon pnömoni (immünosupresyon hastalar) dahil olmak üzere diğer enfeksiyonlarda rol oynayabilir.