Entomoeba histolytica, submukozaya kadar ilerleyip yanlara doğru yayılır. Ağzı dar, tabanı geniş ülserler yapar. “Flask-shaped amoebic ulcers”. E. histolytica patojen hale geldiğinde, kolon bezlerinin kriptlerini istila eder ve submukozaya doğru oyuklar açar. Muskularis propria tarafından durdurulur, bu nedenle daha sonra yanlara doğru oyuklar açar ve ortaya çıkan iltihap ve nekrozla birlikte şişe şeklinde bir ülser oluşur.