Demir emiliminin yetersiz olması demir eksikliğine ve demir eksikliği anemisine yol açan birçok hastalık vardır . Tedavi, hepcidin düzeylerine bağlı olacaktır; çünkü hepcidin enteral emilimi engelliyorsa oral tedavinin etkili olması olası değildir; bu durumlarda parenteral demir tedavisi uygun olacaktır. Çalışmalar, hepcidin ölçümünün bir hasta için en uygun tedaviyi belirlemeye yardımcı olacağını bulmuştur , ancak bu yaygın olarak mevcut olmadığından, C-reaktif protein (CRP) bir vekil belirteç olarak kullanılmaktadır.
Kronik alkol tüketimi, karaciğerde aşırı demir birikimine yol açabilir ve bu da alkolik karaciğer hastalığının gelişimine katkıda bulunabilir. Kronik alkol kullanımı, hepcidin gen ekspresyonunu inhibe ederek demir birikimini artırabilir . Ana mekanizmalar, metaboliti asetaldehit yoluyla oksidatif stresi artırmak ve makrofajlardan interlökin 6’nın (IL-6) salınımını inhibe etmek gibi görünmektedir; bu eylemlerin her biri , aksi takdirde hepcidin ekspresyonunu uyaracak olan transkripsiyon faktörü C/EBPα’nın ekspresyonunu ve DNA bağlama aktivitesini azaltır .
En yaygın doğuştan anemilerden biri olan beta talasemi , hemoglobinin bir bileşeni olan beta-globinin kısmi veya tam sentezinin yetersizliğinden kaynaklanır . Aşırı demir emilimi, beta talaseminin başlıca özelliklerinden biridir ve ciddi morbidite ve mortaliteye yol açabilir. Beta talasemili farelerin seri analizleri, hemoglobin seviyelerinin zamanla azaldığını, karaciğer , dalak ve böbreklerdeki demir konsantrasyonunun ise önemli ölçüde arttığını göstermektedir. Demir fazlalığı, düşük hepcidin seviyeleriyle ilişkilidir. Beta talasemili hastalarda hepcidin seviyeleri de düşüktür. Bu gözlemler, araştırmacıları beta talasemide eritropoez için gerekenden daha fazla demir emildiği hipotezini ortaya atmaya yöneltmiştir. Beta talasemili farelerde hepcidin ekspresyonunun artırılması, demir fazlalığını sınırlandırır, ayrıca çözünmeyen membran bağlı globinlerin ve reaktif oksijen türlerinin oluşumunu azaltır ve anemiyi iyileştirir. Hepcidin ekspresyonu artırılmış farelerde ayrıca kırmızı kan hücrelerinin ömründe artış , etkisiz eritropoezin ve splenomegalinin tersine çevrilmesi ve toplam hemoglobin seviyelerinde artış gözlemlenmiştir. Bu verilerden yola çıkarak araştırmacılar, hepcidin seviyelerini artırmak veya hepcidin agonistleri olarak hareket etmek için kullanılan terapötiklerin, beta talasemi ve ilgili bozuklukları olan bireylerde anormal demir emilimini tedavi etmeye yardımcı olabileceğini öne sürmüşlerdir. Farelerle yapılan daha sonraki çalışmalarda, eritroferronun hepcidin baskılanmasından sorumlu faktör olduğu öne sürülmüştür. Bu farelerde hepcidin ve demir seviyelerinin düzeltilmesi anemilerini iyileştirmemiştir.