DNA Tamir Mekanizmaları: BER-Baz-Kesim Tamiri ve MMR-Yanlış Eşleşme Tamiri

ÖzellikBaz-Kesim Tamiri (BER)Yanlış Eşleşme Tamiri (MMR)
Hedef HatalarKüçük baz değişiklikleri:
– Sitozin deaminasyonu (Urasil oluşumu)
– Adenin deaminasyonu (Hipoksantin)
– Oksidatif/metilasyon hasarları
Replikasyon hataları:
– Yanlış baz eşleşmeleri (G–T, A–C vb.)
– Replikasyon sırasında küçük ins/del hataları
Başlatıcı Enzim(ler)DNA glikozilaz (yanlış bazı tanır ve çıkarır)MutS homologları (MSH2, MSH6) yanlış eşleşmeyi tanır
Ara ÜrünAP (apürinik/apirimidinik) bölge oluşurHatalı bölge işaretlenir, kesilerek çıkarılır
Diğer ProteinlerAP endonükleaz, DNA polimeraz β, DNA ligazMutL (MLH1, PMS2) kompleksi, ekzonükleaz, DNA polimeraz δ/ε, DNA ligaz
Yeni/Kalıp Zincir AyrımıGerek yok (sabit hasar mevcut)Kalıp zincir metillenmiş, yeni zincir henüz metillenmemiş (özellikle bakterilerde). İnsanlarda PCNA ile replikasyon zinciri ayrılır
SonuçYanlış baz çıkarılır → doğru baz eklenir → zincir onarılırYanlış eşleşme çıkarılır → kalıp zincire uygun nükleotid eklenir
Klinik ÖnemiBER defekti → Mutasyon birikimi, kansere yatkınlıkMMR defekti → Mikrosatellit instabilitesi → Lynch sendromu (HNPCC), kolorektal ve endometriyal kanser riski

🔑 Kısacası:

  • BER: Küçük kimyasal baz hasarlarını temizler.
  • MMR: DNA polimerazın yaptığı yanlış eşleşmeleri düzeltir.