Aksesuar okülomotor çekirdekler, diensefalonla birleştiği yere yakın rostral mezensefalonda (orta beyin) bulunan bir grup çekirdektir ve şunlardan oluşur:
1-Cajal’ın interstisyel çekirdeği
2-Medial longitudinal fasikülüsün rostral interstisyel çekirdeği
3-Darkschewitsch’in çekirdeği
4-Posterior komissür çekirdeği
Bu çekirdekler dikey ve döner bakışta (fizyoloji) ve düzgün takipte rol oynarlar. Görsel ilişki alanından afferentler alırlar ; medial longitudinal fasikülüs aracılığıyla efferentleri , dışsal göz kaslarını kontrol eden kranial sinirlerin çekirdeklerine yansıtırlar .