Metforminden kaynaklanan laktik asidozun patofizyolojisi, muhtemelen piruvatı oksaloasetata dönüştüren glukonegenezin ilk adımı olan piruvat karboksilazı bloke ederek glukoneogenezin inhibisyonundan kaynaklanmaktadır. Bu enzimi bloke etmek laktik asit birikmesine yol açar.Metformine bağlı laktik asidozun mekanizması tam anlamıyla anlaşılamamıştır. Ancak piruvat karboksilazı suprese ederek laktat metabolizmasını azalttığı ve karaciğerde pH’ı azaltma yolları ile laktat üretimini arttırdığı düşünülmektedir. Ayrıca glukoz kullanımını azaltır ve hepatositten laktik asit salınımını arttırır. Karaciğerde, FOX proteini “FOX (forkhead box) proteins ” FOXO6 normalde açlık durumunda glukoneogenezi teşvik eder, ancak insülin beslenme sırasında FOXO6’yı bloke eder. İnsülin direnci durumunda , insülin FOXO6’yı bloke edemez ve bu da beslenme sırasında bile glukoneogenezin devam etmesine neden olur ve bu da yüksek kan şekeri ( hiperglisemi ) ile sonuçlanır . İnsülin direnci, metabolik sendromun ve tip 2 diyabetin ortak bir özelliğidir . Bu nedenle, glukoneogenez , glukoneojenik glikoz oluşumunu engelleyen ve hücreler tarafından glikoz alımını uyaran antidiyabetik ilaç metformin gibi tip 2 diyabet için bir terapi hedefidir