Tip III salgı sistemi terimi 1993 yılında türetilmiştir. Bu salgı sistemi, gram-negatif bakterilerde bulunan en az beş diğer salgı sisteminden farklıdır . Birçok hayvan ve bitki ilişkili bakteri benzer T3SS’lere sahiptir. Bu T3SS’ler yakınsak evrimin bir sonucu olarak benzerdir ve filogenetik analiz, gram-negatif bakterilerin T3SS gen kasetini yatay olarak diğer türlere aktarabildiği bir modeli destekler . En çok araştırılan T3SS’lerden bazıları şu türlerdendir:
Shigella ( basilli dizanteriye neden olur ),
Salmonella ( tifo ateşi ),
Escherichia coli ( Bağırsak florası , bazı suşları gıda zehirlenmesine neden olur ),
Vibrio ( gastroenterit ve ishal ),
Burkholderia ( ruam ),
Yersinia ( veba ),
Klamidya ( cinsel yolla bulaşan hastalık ),
Pseudomonas ( insanları , hayvanları ve bitkileri enfekte eder ) ve
Erwinia , Ralstonia ve Xanthomonas gibi bitki patojenleri ve bitki simbiyonu Rhizobium .