Pirüvat dehidrogenaz, anti-mitokondriyal antikorlar (AMA) olarak bilinen bir otoantijen tarafından hedef alınır ve bu da karaciğerin küçük safra kanallarının ilerleyici yıkımına ve **********primer bilier siroza yol açar . Bu antikorlar, inflamatuar bağışıklık tepkilerinden kaynaklanan oksitlenmiş proteini tanıyor gibi görünmektedir. Bu inflamatuar tepkilerin bazıları glütene karşı duyarlılıkla ilişkili olabilir ; bir çalışmada akut karaciğer yetmezliği hastalarının %50’sinden fazlasında doku transglutaminazına karşı mitokondriyal olmayan bir otoantikor görülmüştür .
Diğer mitokondriyal otoantijenler arasında, anti-mitokondriyal antikorlar tarafından tanınan antijenler olan oksoglutarat dehidrogenaz ve dallı zincirli alfa-keto asit dehidrogenaz kompleksi bulunur . Artan pirüvat dehidrogenaz (PDH) aktivitesi, onkogen kaynaklı hücresel yaşlanmaya neden olabileceği gibi yaşlanmayı da teşvik edebilir. Yaşla birlikte mitokondriyal PDH aktivitesinin azaldığı kalpte ve beynin belirli bölgelerinde ( striatum ve beyin sapı ) gösterilmiştir. Pirüvat dehidrogenaz (PDH) eksikliği, X kromozomunda bulunan pirüvat dehidrogenaz kompleksinin (PDC) mutasyonundan kaynaklanan konjenital dejeneratif metabolik bir hastalıktır. Kompleksin 3 enziminde de kusurlar tanımlanmış olsa da, asıl suçlu E1-α alt birimidir. PDH eksikliği nedeniyle sitrik asit döngüsünün bozulması, vücudu enerjiden mahrum bırakır ve anormal bir laktat birikimine yol açar.
PDH eksikliği, yenidoğanlarda laktik asidozun yaygın bir nedenidir ve genellikle şiddetli uyuşukluk, yetersiz beslenme, taşipne ile kendini gösterir ve ölüm vakaları meydana gelmiştir.