Uzun kodlamayan RNA’lar ( uzun ncRNA’lar , lncRNA ) genellikle proteine çevrilmeyen 200’den fazla nükleotid içeren transkriptler olarak tanımlanan bir RNA türüdür .
Bu keyfi sınır, uzun ncRNA’ları mikroRNA’lar (miRNA’lar), küçük girişimci RNA’lar (siRNA’lar), Piwi ile etkileşen RNA’lar (piRNA’lar), küçük nükleolar RNA’lar (snoRNA’lar) ve diğer kısa RNA’lar gibi küçük kodlamayan RNA’lardan ayırır. Bazı lncRNA’ların küçük proteinleri veya mikro-peptitleri kodlama potansiyeline sahip olduğu bildirildiği için, lncRNA’nın en son tanımı, kodlama kapasitesi olmayan veya sınırlı olan 200’den fazla nükleotid içeren bir RNA molekülü sınıfıdır. Uzun girişimci/genler arası kodlamayan RNA’lar (lincRNA’lar), protein kodlayan genlerle örtüşmeyen lncRNA dizileridir.
Birçok ilişki çalışması hastalık durumlarında uzun ncRNA’ların alışılmadık ifadesini belirlemiş olsa da, hastalığa neden olmadaki rolleri hakkında çok az bilgi vardır. Tümör hücreleri ile normal hücreleri karşılaştıran ifade analizleri, çeşitli kanser türlerinde ncRNA ifadesinde değişiklikler olduğunu ortaya koymuştur . Örneğin, prostat tümörlerinde PCGEM1 (aşırı ifade edilen iki ncRNA’dan biri) artan çoğalma ve koloni oluşumu ile ilişkilidir ve bu da hücre büyümesinin düzenlenmesinde rol oynadığını düşündürmektedir. PRNCR1’in prostat kanseri, meme kanseri , küçük hücreli olmayan akciğer kanseri , oral skuamöz hücreli karsinom ve kolorektal kanser gibi çeşitli malignitelerde tümör büyümesini desteklediği bulunmuştur . [ 142 ] MALAT1 (NEAT2 olarak da bilinir) başlangıçta erken evre küçük hücreli olmayan akciğer kanserinin metastazı sırasında yukarı düzenlenen bol miktarda ifade edilen bir ncRNA olarak tanımlanmıştır ve aşırı ifadesi zayıf hasta sağkalım oranları için erken bir prognostik belirteçtir. HEAT2 veya KCNQ1OT1 gibi LncRNA’ların kalp yetmezliği veya koroner arter hastalığı gibi kardiyovasküler hastalıkları olan hastaların kanında düzenlendiği ve dahası kardiyovasküler hastalık olaylarını tahmin ettiği gösterilmiştir.
Daha yakın zamanda, MALAT1’in oldukça korunan fare homologunun hepatosellüler karsinomda yüksek oranda ifade edildiği bulunmuştur . Prostat kanseri örneklerinde tümör farklılaşma derecesiyle ilişkili ifadeye sahip intronik antisens ncRNA’lar da bildirilmiştir. Kanserde anormal ifadeye sahip bir dizi uzun ncRNA’ya rağmen, bunların tümör oluşumundaki işlevi ve potansiyel rolü nispeten bilinmemektedir. Örneğin, ncRNA’lar HIS-1 ve BIC, kanser gelişimi ve büyüme kontrolünde rol oynamaktadır, ancak normal hücrelerdeki işlevleri bilinmemektedir. Kansere ek olarak, ncRNA’lar diğer hastalık durumlarında da anormal ifade sergiler. PRINS’in aşırı ekspresyonu sedef hastalığına yatkınlıkla ilişkilidir ve PRINS ekspresyonu sedef hastalığı olan hastaların etkilenmemiş epidermisinde hem sedef hastalığı lezyonlarına hem de sağlıklı epidermise kıyasla yüksektir .
Genom çapında profilleme, birçok transkripsiyonlu kodlamayan ultra muhafazalı bölgenin çeşitli insan kanser durumlarında farklı profiller sergilediğini ortaya koydu.
Kronik lenfositik lösemi , kolorektal karsinom ve hepatosellüler karsinomun analizi, üç kanser türünün de normal hücrelere kıyasla ultra muhafazalı ncRNA’lar için anormal ifade profilleri sergilediğini buldu. Bir ultra muhafazalı ncRNA’nın daha ileri analizi, apoptozu hafifleterek ve daha sonra kolorektal kanserlerdeki kötü huylu hücre sayısını artırarak bir onkogen gibi davrandığını ileri sürdü. Kanserde farklı imzalar sergileyen bu transkripsiyonlu ultra muhafazalı bölgelerin çoğu, kanserle ilişkili kırılgan bölgelerde ve genomik bölgelerde bulunur. Bu ultra muhafazalı ncRNA’ların kötü huylu süreçlerdeki anormal ifadesinin, normal insan gelişiminde yerine getirdikleri önemli işlevlerden kaynaklanması muhtemeldir.