Böbrek biyopsisi LN tanısı ve sınıflandırması için gereklidir ve uzman nefropatologlar tarafından değerlendirilmelidir. SLE ve proteinüri >0,5 g/24-saat (veya uPCR >0,5 g/g) olan hastalarda önerilir.
Hematüri, lökositüri veya idrar dökümleri ve/veya açıklanamayan böbrek fonksiyon bozukluğunun varlığı biyopsi endikasyonunu daha da güçlendirir.
Proteinürisi olmayan ancak aktif idrar sedimenti ve/veya böbrek fonksiyon bozukluğu olan hastalarda böbrek biyopsisi yapılmadan önce SLE dışındaki etyolojileri dışlamak için dikkatli bir çalışma yapılmalıdır.