Metilen mavisi; guanilat siklazı inhibe ederek, etkilerini bu yolla oluşturan NO ve ANP gibi endojen maddeler ile organik nitrat ve sodyum nitroprussid gibi NO açığa çıkaran ilaçların etkilerini azaltır. Metilen mavisi ayrıca methemoglobinemi tedavisinde kullanılır.