RNA polimeraz I 45S pre-rRNAyı sentezlerler, bu olgunlaşıp ribozomda yer alan 28S, 18S ve 5,8S rRNA moleküllerini oluşturur.
RNA polimeraz II, mRNA’ların öncüllerini ve çoğu snRNA ve mikroRNA’yı sentezler. Bu polimeraz üzerinde en fazla araştırmanın yapılmış olanıdır. Pek çok transkripsiyon faktörü onun promotörlere bağlanmasına etki eder.
RNA polimeraz III, tRNA, 5S rRNA ve diğer bazı küçük RNA’ları sentezler.
RNA polimeraz II, α-Amanitin ve diğer amatoksinler tarafından inhibe edilir . α-Amanitin, birçok mantarda bulunan oldukça zehirli bir maddedir.Mantar zehrinin her bir RNA Polimerazı üzerinde farklı etkileri vardır: