Haemophilus influenzae, Gram ile zor da olsa, mavi-menekşe renkte, Yersinia’lar gibi kutupsal ve (-) boyanırlar.Hareketsiz, bazen pleomorfık olabilen, kapsüliü kokobasillerdir. Kapsülpoliribozil ribitol fosfat (PRP) yapısında olup, virulans ile yakından ilgilidir, bakteriyi fagositozdan korur. Ayrıca, Pnömokok ve Meningokoklar gibi, IgAlproteaz enzimi ile salgısal IgA’nın koruyucu etkisini kaldırır. Kapsülüne göre 6 farklı antijenik serotipe ayrılmıştır. Tip b (Hib), invazif tüm H. influenzae türlerinin % 95 ‘inden sorumludur.