ATP Sentezi
Solunum zinciri I, III ve IV kompleksleri proton pompası olarak davranır.
İç membran protonlara karşı geçirgen olmadığından dolayı protonların sürekli olarak dış kısımda birikmesi elektro kimyasal potansiyel farkı yaratır. Aynı zamanda artan protonlar pH gradienti yanı sıra pozitif yükünde artmasına neden olurlar
Bu gradientler membranda lokalize ATP sentaz’ın aktivasyonuna yol açar (Kemiosmotik hipotez).
1 ATP sentezi için 4 protona gereksinim bulunur. 3 proton ATP sentetaz aktivitesi için, 1 protonda ADP’nin fosforilasyonu için gerekli inorganik fosfatı mitokondri matriksine girişi için gereklidir.