Defektif Alfa-1-antitripsin proteinleri hepatositlerden sekrete edilemezler ve hepatosit hasarına neden olurlar. Normal insanlarda PİMM tipinde Alfa-1 AT bulunur.
Defektif sentezlenen ve bozuk katlanan çeşitli Alfa-1-antitripsin tipleri vardır. Bunlardan en sık olanı PİZZ tip defektif proteinlerdir, Alfa-1-antitripsin eksikliği nötrofil kaynaklı elastaz aktivitesinin kontrolsüz kalmasına ve pulmoner elestik doku yıkımı oluşturarak, tüm akciğer asiner yapısının bozulması ile panasiner amfizem’e neden olur.
Respiratuvar bronşiollerden terminal alveole kadar (hem respiratuar bronşioller hem de Alveollerin duvarları hasarlanıp genişlerler) geri dönüşümsüz bir genişleme vardır. Bu olay, perfüzyonun daha fazla olduğu akciğer Alt loblarında daha belirgindir.
