MALDI-TOF-MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization–Time of Flight–Mass Spectrometry), günümüzde mikrobiyoloji, patoloji, proteomik ve biyomedikal tanı alanlarında en güçlü hızlı tanımlama ve moleküler analiz teknolojilerinden biridir.

Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization – Time of Flight – Mass Spectrometry
(Matris Destekli Lazer Desorpsiyon/İyonizasyon – Uçuş Zamanı Kütle Spektrometrisi)

Temel işlev: Bir biyolojik örnekteki proteinleri iyonlaştırarak kütle/yük oranına (m/z) göre ayırır ve tanımlar.
Özellikle bakteri, mantar, maya, hatta bazı virüslerin tanımlanmasında kullanılır.

Çalışma Prensibi (Basamaklar)

BasamakAçıklama
1. Matris HazırlığıBiyolojik örnek (ör. bakteri kolonisi) özel bir organik matris (genellikle sinapinik asit veya α-siyano-4-hidroksisinnamik asit) ile karıştırılır.
2. Lazer Desorpsiyonu / İyonizasyonLazer ışını matrise vurur → matris enerjiyi emer → örnek yüzeyinden iyonlar (pozitif yüklü protein parçacıkları) kopar.
3. Uçuş Tüpüne Giriş (Time of Flight – TOF)İyonlar elektrik alanla hızlandırılarak vakumlu bir tüpe gönderilir.
4. Uçuş Zamanı ÖlçümüHafif iyonlar hedefe daha hızlı ulaşır; ağır iyonlar daha yavaş. Uçuş süresi, iyonun kütle/yük oranını (m/z) gösterir.
5. Spektrum AnaliziDedektörde oluşan sinyaller bilgisayar tarafından “protein parmak izi” haline getirilir. Elde edilen spektrum, referans veri tabanıyla karşılaştırılır.

Klinik Mikrobiyolojide Kullanımı

Kullanım AlanıAçıklama
Bakteri tanımlamaKlinik örneklerden izole edilen kolonilerden 5–10 dakika içinde tanı (ör. E. coli, S. aureus, Klebsiella, Candida).
Mantar tanımlamaÖzellikle Candida, Aspergillus, Malassezia türlerinde yüksek doğruluk.
Antibiyotik direnç belirteci tespitiBazı karbapenemaz veya β-laktamaz enzimlerinin kütle profiliyle saptanması.
Kan kültürü pozitif örneklerde doğrudan tanıGram boyama sonrası 15–30 dakikada tür düzeyinde tanı.
Epidemiyolojik tiplendirmeAynı tür içindeki suş farklılıklarını protein profiliyle ayırt eder.

Klasik yöntemle 24–48 saat süren tanı, MALDI-TOF ile 10–15 dakikada elde edilebilir.

Cihaz Bileşenleri

Bileşenİşlev
Lazer Kaynağıİyonizasyonu başlatır (genellikle azot lazer, 337 nm)
Matris Plakası (Target plate)Numune-matris karışımı yerleştirilir
Vakumlu Uçuş Tüpüİyonların serbest hareket ettiği ortam
Dedektör (Ion detector)İyonların geliş zamanını ölçer
Veri tabanı / YazılımSpektrumu analiz eder ve tür tanısı verir

Spektrum Mantığı

  • Her mikroorganizma türü, özellikle ribozomal protein profili açısından kendine özgü bir kütle spektrumu üretir.
  • Spektrumda 2000–20 000 Da aralığındaki proteinler esas alınır.
  • Cihaz, bu parmak izini referans kütüphane ile eşleştirerek tür tanısı verir.

Örnek: Staphylococcus aureus spektrumu → 4350 Da, 5890 Da, 6715 Da pikleriyle karakteristik.

Avantajlar ve Sınırlamalar

AvantajAçıklama
Çok hızlı tanıKoloniden tür düzeyinde tanımlama 5–10 dakikada
Yüksek özgüllük%95–99 doğrulukla tür tanımlama
Düşük maliyet (uzun vadede)Kimyasal reaktif ve kit masrafı çok az
Veritabanı genişletilebilirYeni türler eklenebilir
Direnç tespiti potansiyeliβ-laktamaz, karbapenemaz vb. enzimleri saptayabilir
SınırlamaAçıklama
Referans veritabanına bağımlıVeri tabanında olmayan tür tanınamayabilir
Karışık kültürlerde zayıfBirden fazla tür varsa tanımlama güçleşir
Direnç genleri doğrudan saptanamazYalnızca fenotipik yansımalar görülebilir
Özel hazırlık gerekebilirMantar ve mikobakteriler için ekstraksiyon basamağı gerekir

Uygulama Alanları

AlanKullanım
🧫 Klinik mikrobiyolojiTür tanımlama, direnç belirteci analizi
🧪 Proteomik araştırmalarProteinlerin kütle spektroskopik profili
🧍‍♀️ Adli bilimlerDoku, kan, biyolojik iz tanımlama
🧬 Moleküler biyolojiPeptid haritalama, posttranslasyonel modifikasyon araştırmaları

Örnek Klinik Senaryo

🔹 Hasta: Septik tabloyla başvuran birey
🔹 Kan kültürü: Gram-negatif basiller
🔹 MALDI-TOF sonucu (10 dk): Klebsiella pneumoniae
🔹 Ek analiz: Karbapenemaz paternine uygun pik → karbapenem direnci şüphesi
🔹 Klinik fayda: Uygun antibiyotiğe erken geçiş, mortalitede azalma.


Özet

BaşlıkAçıklama
Teknoloji tipiKütle spektrometrisi
İyonizasyon şekliLazerle matris destekli desorpsiyon
Ayrım kriteriKütle / yük oranı (m/z)
Temel kullanım alanıMikrobiyolojik tanı, proteomik analiz
Zaman avantajıDakikalar içinde tanı
Klinik örnekKoloni veya pozitif kan kültürü