Sistitis sistika’da ürotelyum lamina propriaya doğru kıvrılarak Von Brunn yuvaları oluşturur ve daha sonra kistik olarak genişlemiş sıvı dolu veziküllere dönüşür. Bazı durumlarda, sistitis sistika ve florid von Brunn yuva proliferasyonunu ürotelyal karsinomun yuvalanmış varyantından ayırt etmek zordur. Bu tür bir ayrım, ürotelyal karsinom agresif bir malignite olduğundan kritik olabilir. TERT promotöründe mutasyon bulmak, potansiyel olarak tehlikeli yuvalanmış ürotelyal karsinomu ve iyi huylu taklitçileri ayırt etmek için iyi bir yöntemdir. Brüt olarak, sistitis sistika küçük (<5 mm) yarı saydam submukozal kistler gösterebilir veya normal görünebilir.
Mikroskobik olarak, sistitis sistika ürotelyumda bol miktarda von Brunn yuvasına sahip olacaktır.
Diğer özellikler şunlardır:
1-Dejeneratif atipi
2-Eozinofilik sıvı içeren genişlemiş lümenler ve kistler
3-Lobüler invaginasyonlar
4-Önemli hücresel atipi, mitotik aktivite, kas invazyonu veya stromal reaksiyon yok
5-Sızdırmayan büyüme deseni
Sistitis sistika’da hücreler lamina propriaya yüzeyeldir, adenokarsinomda ise derin kas tabakası istila edilmiştir. Diğer kötü huylu kriterler arasında atipi, sık anormal mitotik figürler, artmış nükleer-sitoplazmik oran ve nekroz bulunur. İmmünohistokimya, karmaşık vakalarda 2 varlığı ayırt etmek için kullanılabilir. Örneğin, sistitis sistika yuvalarındaki ürotelyal hücreler p63 için pozitif boyanırken , nefrojenik adenom p63 negatiftir.