Candida – C. albicans, merkezi sinir sistemi enfeksiyonlarına neden olan en yaygın Candida türüdür.
Coccidioides – güneybatı Amerika Birleşik Devletleri ve Meksika’ya özgüdür. Yaygın koksidioidomikoz ile başvuran hastaların üçte birinde menenjit gelişmiştir.
Histoplazma – kuş ve yarasa dışkılarında oluşur ve Amerika Birleşik Devletleri, Güney ve Orta Amerika’nın bazı bölgelerine özgüdür. Yaygın histoplazmoz vakalarının yaklaşık %10-20’sinde merkezi sinir sistemi tutulumu meydana gelir.
Blastomyces – Ortabatı Amerika Birleşik Devletleri’nde çürüyen organik madde bakımından zengin toprakta meydana gelir. Menenjit, blastomikozun alışılmadık bir belirtisidir ve teşhis edilmesi çok zor olabilir.
Cryptococcus ( Kriptokokal menenjit ) – kuş pisliği ile kirlenmiş toprağın solunması yoluyla bulaştığı düşünülmektedir. C. neoformans , mantar menenjitine neden olan en yaygın patojendir.
Aspergillus – Aspergillus enfeksiyonları, merkezi sinir sistemini içeren mantar enfeksiyonlarının %5’ini oluşturur.